生物安全柜可分為一級(jí)、二級(jí)和三級(jí)三大類以滿足不同的生物研究和防疫要求：

一級(jí)生物安全柜可保護(hù)工作人員和環(huán)境而不保護(hù)樣品。氣流原理和實(shí)驗(yàn)室通風(fēng)櫥一樣，不同之處在于排氣口安裝有HEPA過濾器。所有類型的生物安全柜都在排氣和進(jìn)氣口使用HEPA過濾器。一級(jí)生物安全柜本身無風(fēng)機(jī)，依賴外接通風(fēng)管中的風(fēng)機(jī)帶動(dòng)氣流，由于不能對(duì)試驗(yàn)品或產(chǎn)品提供保護(hù)，目前已較少使用。

二級(jí)生物安全柜是目前應(yīng)用為廣泛的柜型。 與Ⅰ級(jí)生物安全柜一樣，Ⅱ級(jí)生物安全柜也有氣流流入前窗開口，被稱作“進(jìn)氣流”，用來防止在微生物操作時(shí)可能生成的氣溶膠從前窗逃逸。與Ⅰ級(jí)生物安全柜不同的是，未經(jīng)過濾的進(jìn)氣流會(huì)在到達(dá)工作區(qū)域前被進(jìn)風(fēng)格柵俘獲，因此試驗(yàn)品不會(huì)受到外界空氣的污染。 Ⅱ級(jí)生物安全柜的一個(gè)獨(dú)特之處在于經(jīng)過HEPA過濾器過濾的垂直層流氣流從安全柜頂部吹下，被稱作“下沉氣流”。下沉氣流不斷吹過安全柜工作區(qū)域，以保護(hù)柜中的試驗(yàn)品不被外界塵埃或細(xì)菌污染。

三級(jí)生物安全柜是為4級(jí)實(shí)驗(yàn)室生物安全等級(jí)而設(shè)計(jì)的，是目前上安全防護(hù)等級(jí)的安全柜。柜體完全氣密，100％全排放式，所有氣體不參與循環(huán)，工作人員通過連接在柜體的手套進(jìn)行操作，俗稱手套箱(Golve box)，試驗(yàn)品通過雙門的傳遞箱進(jìn)出安全柜以確保不受污染，適用于高風(fēng)險(xiǎn)的生物試驗(yàn)。

選擇帶證二級(jí)生物安全柜取決于生物試驗(yàn)中所使用的試驗(yàn)品類型。

1、如果生物試驗(yàn)中只涉及微生物樣品，可以使用基本類型的生物安全柜；

2、如果生物試驗(yàn)中涉及了微生物樣品和微量化學(xué)試劑（非腐蝕性），使用裝備外排管道的安全柜是必要的。因?yàn)镠EPA過濾器并不能有效過濾清除化學(xué)氣體，如果不能外排，將對(duì)實(shí)驗(yàn)室內(nèi)工作人員和環(huán)境造成威脅；

3、如果生物試驗(yàn)中涉及了細(xì)胞毒素類藥物，例如各類癌癥治療藥物，必須使用的細(xì)胞毒素安全柜。

另外，需要明確了解生物安全柜與通風(fēng)柜/超凈工作臺(tái)的區(qū)分。通風(fēng)柜和超凈工作臺(tái)不屬于生物安全柜，不可使用在涉及微生物材料的實(shí)驗(yàn)或生產(chǎn)過程中。