目前色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀在分析儀器中具有重要地位。由于色譜儀的色譜柱具有的分離能力，把物質(zhì)按保留時間大小進行分離，然后通過與標(biāo)樣保留時間進行對比的方法確定物質(zhì)性質(zhì)，因此對未知樣品很難定性分析。而質(zhì)譜儀是直接測定物質(zhì)的質(zhì)量數(shù)與電荷的比值（m/z）在定性分析方面既準確又快速。把色譜與質(zhì)譜聯(lián)合起來使用，色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀型式試驗實際上是把質(zhì)譜儀作為色譜儀的一個通用檢測器來使用。
色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀基本工作原理
為了質(zhì)譜儀器的正常工作，必須要組成高真空系統(tǒng)的真空室。儀器使用了高性能的渦輪分子泵與前級真空泵構(gòu)成兩級真空機組以確保所需的真空。被分析樣品經(jīng)毛細管柱分離，進入離子源。采用電子電力標(biāo)準配置（EI），產(chǎn)生正離子，在推斥、聚焦、引出電的作用下將正離子送入四桿系統(tǒng)。四桿在高頻電壓與正負電壓聯(lián)合作用下形成高頻電場，在掃描電壓作用下，只有符合四場運動方程的離子才能通過四桿對稱中心到達離子檢測器，再經(jīng)離子流放大器放大，產(chǎn)生質(zhì)譜信號。得到了質(zhì)譜圖，通過解釋譜圖或進行譜庫檢索以識別未知樣品的組成。
色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀組成部分
（一）、真空系統(tǒng)：
2級真空：
機械泵和渦輪分子泵
機械泵一般時前級真空，也就是在機械泵把真空降到一定水平后才啟動渦輪分子泵，以保護分子泵。所以儀器從大氣壓到真空合適的狀態(tài)一般要經(jīng)過一段時間的。
（二）、進樣系統(tǒng)：
從分離裝置來的組分（氣體或者液體）或者從直接進樣桿進液體或者固體樣品。
（三）、離子源
離子源： 主要作用是使欲分析的 樣品實現(xiàn)離子化，尤其是中性物質(zhì)帶上電荷。
樣品本身性質(zhì)的差異，決定了離子化的方式不能有的離子源，離子源的類型也是多種多樣。
（四）、質(zhì)量分析器
質(zhì)量分析器是質(zhì)譜儀的核心部件，因此常以質(zhì)量分析器的類型來命名一臺質(zhì)譜儀。
( 五）、檢測器：目前是光電倍增器應(yīng)用較廣。
( 六）、采集數(shù)據(jù)和控制儀器的工作站。 
色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀應(yīng)用范圍
1、應(yīng)對各種突發(fā)事件，如有害物質(zhì)泄漏、重大環(huán)境災(zāi)害等。
2、凡是需要氣相色譜儀進行檢測的場合，特別是對未知樣品進行定性分析的地方。
3、反恐斗爭、禁毒緝毒、爆炸物品分析等。