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多重PCR擴增試劑盒,你使用對了嗎?

發(fā)布時間:2019-09-04瀏覽次數(shù):2043返回列表

試劑盒的正確使用與否直接關(guān)乎著試驗的成功與否,快來對照一下多重PCR擴增試劑盒,你使用對了嗎!

 

所謂多重PCRMultiplex Polymerase Chain Reaction,mPCR),也稱復(fù)合PCR,由Chambehian' 1988年提出(Chambehian' et.al.Nucleic Acids Res、1988 Dec 9; 16(23): 1114111156.),基本原理與常規(guī)PCR相同,區(qū)別在于多重PCR的反應(yīng)體系是加入多對引物,各對引物分別結(jié)合在模板的相應(yīng)位置,zui終擴增出多條DNA片段。

 

多重PCR實驗流程

相比于液相雜交,多重PCR的是特異性強,實驗周期短,技術(shù)也相對簡單。下面為大家介紹實驗流程:

我們公司多重PCR的實驗,就是由兩輪PCR完成。di一輪PCR的作用是利用目標(biāo)區(qū)域特異的引物去擴增,得到的產(chǎn)物是目標(biāo)區(qū)域的富集片段,因此,此步驟也是實現(xiàn)了從基因組中“捕獲”目標(biāo)區(qū)域的目的。

之后把得到的產(chǎn)物進行純化,再通過第二輪PCR中引入IndexAdaptor。

這樣,在經(jīng)過了兩輪PCR后,就獲得了完整的文庫。把第二輪PCR產(chǎn)物純化后,就可以定量,測序了。

 

實驗注意事項:

1、先從樣本說起,我們公司的多重PCR平臺可以做的樣本包括血液,唾液,口腔拭子,在實驗中,對于DNA投入量要求不是很高,根據(jù)不同項目需求,DNA投入量的范圍在100 pg100 ng 之間。

2、進行PCR反應(yīng)前,可以將所有 gDNA 的濃度稀釋到同一濃度,并轉(zhuǎn)移到 PCR 8 聯(lián)管中,一方面是便于排槍操作,另一方面是加入相同起始量的 gDNA,這樣可以降低zui終文庫的濃度差異,便于混合文庫。

3、大多數(shù)情況下引物是1管,操作相當(dāng)方便;當(dāng)目標(biāo)區(qū)域是外顯子或者是其他連續(xù)區(qū)域時,我們會把引物分裝為2管,分別命名Primer pool T1Primer pool T2,這時需要第二輪PCR前把產(chǎn)物合并,再進行下一步反應(yīng)。

4、執(zhí)行多重PCR反應(yīng)時,特別是樣本量多的情況下,可以將 T1 設(shè)為一組,T2 設(shè)為一組,便于制備反應(yīng)試劑混合液和排槍操作; 并把解凍好的試劑放置在冰盒上,在冰盒上進行加樣操作。

5、在實驗中,可以在PCR管壁上和管蓋上同時進行反應(yīng)編號標(biāo)記,防止高溫或其他原因?qū)е掠浱栂В苊夂罄m(xù)產(chǎn)物混合操作失誤, 造成樣本交叉污染。

6、第二輪PCR后,因為YF Buffer B試劑比較粘稠,在清洗純化的時候不能吸走所有試劑,可以剩余5-10μl,否則會把磁珠一起吸走,造成樣品的損失,導(dǎo)致產(chǎn)物回收率下降。

 

當(dāng)實驗完成后,正常文庫濃度處于5-30 ng/μl,而片段長度一般在280-460 bp之間,且主峰前后無雜峰,就可以進行測序了。

 






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