BTN100212 一管式點(diǎn)突變?cè)噭┖?/h1>



產(chǎn)品簡(jiǎn)介
一管式點(diǎn)突變?cè)噭┖惺歉咂焚|(zhì)的基因結(jié)構(gòu)和功能產(chǎn)品,由北京百奧萊博供應(yīng),本產(chǎn)品用于生化實(shí)驗(yàn)研究等領(lǐng)域,本品質(zhì)量穩(wěn)定,價(jià)位合理,需要一管式點(diǎn)突變?cè)噭┖械然蚪Y(jié)構(gòu)和功能產(chǎn)品的客戶,請(qǐng)到我公司官網(wǎng)聯(lián)系我們。...
產(chǎn)品詳細(xì)介紹
特別提示:包括一管式點(diǎn)突變?cè)噭┖性趦?nèi),本公司的所有產(chǎn)品僅可用于科研實(shí)驗(yàn),嚴(yán)禁用于臨床醫(yī)療及其他非科研用途!
產(chǎn)品名稱:一管式點(diǎn)突變?cè)噭┖?br />
英文名稱:One-Tube Mutagenesis Kit
產(chǎn)品貨號(hào):BTN100212
產(chǎn)品規(guī)格:10次
基因的定點(diǎn)突變是重要的分子生物學(xué)技術(shù),廣泛用于載體構(gòu)建、基因改造、蛋白質(zhì)功能研究等領(lǐng)域。但傳統(tǒng)的方法需要使用單鏈DNA 模板,而得到單鏈DNA 模板又需要先將基因克隆到類似M13 這種載體中,操作過程冗長(zhǎng)。為了克服這些缺點(diǎn),本公司將突變位點(diǎn)設(shè)計(jì)到一對(duì)互補(bǔ)的引物中,用高保真擴(kuò)增質(zhì)粒模板,然后用Dpn I 去除原始的甲基化模板,新合成的DNA 通過互補(bǔ)形成帶切口的雙鏈質(zhì)粒,直接用于轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)菌。
產(chǎn)品特點(diǎn):
1. 直接使用質(zhì)粒DNA作為模板,免去了制備單鏈DNA的步驟。
2.基于高保真PCR,對(duì)模板DNA 序列沒特殊要求,可以用于突變?nèi)魏涡蛄?。同時(shí)對(duì)模板的需求量很少。
3.一管式,全部在一個(gè)優(yōu)化的緩沖體系中完成,非常簡(jiǎn)單。
4. 使用Dpn I 去除未突變模板,突變效率高達(dá)90%。
5.可用于制備點(diǎn)突變,缺失突變和插入突變。
6. 本產(chǎn)品A型適用于8 kb以下,B型適用于8-15 kb。
試劑盒組成:
成分
10T(A型)
10T(B型)
高保真酶A型
10μl
無
高保真酶B型
無
10μl
5×高保真酶Buffer A型
100μl
無
5×高保真酶Buffer B型
無
100μl
dNTP(2.5mM each)
50μl
50μl
Dpn I酶
10μl
10μl
超純水
1ml
1ml
儲(chǔ)存條件:低溫運(yùn)輸、-20℃保存,有效期一年。
使用方法:
一、引物設(shè)計(jì)及注意事項(xiàng)
用于特定基因突變的引物必須用戶單獨(dú)設(shè)計(jì),請(qǐng)參考如下一些基本原則進(jìn)行設(shè)計(jì)。
1. 共需設(shè)計(jì)兩條完全互補(bǔ)的一對(duì)引物,它們覆蓋要擴(kuò)增的突變區(qū)位點(diǎn),突變位點(diǎn)zuì好放在引物的中心。可以先集中設(shè)計(jì)一條,然后就可得互補(bǔ)的另一條引物。
2.引物的長(zhǎng)度通常為25-45個(gè)堿基。引物中突變位點(diǎn)任何一側(cè)都必需滿足Tm大于45的條件,Tm 計(jì)算方式為Tm=4×(GC 堿基數(shù))+2×(AT 堿基數(shù))。例如引物agtcaggccaattcgAAGcagtcgaattgccaag 就達(dá)到此標(biāo)準(zhǔn),它的突變位點(diǎn)AAG 所放位置使左側(cè)Tm=46;右側(cè)Tm=48,均大于45。
3. 盡量把引物的GC含量控制在40%-60%,結(jié)尾的1-3個(gè)堿基zuì好是G或C。
4. 盡量使引物不要產(chǎn)生非常穩(wěn)定的二級(jí)結(jié)構(gòu)和引物二聚體。
5. zuì好使用經(jīng)過PAGE 純化的引物或更高純度的引物。
二、待突變模板質(zhì)粒的選擇
1. 必需使用從dam+的大腸桿菌(這類菌中質(zhì)粒可以被甲基化)中抽提得到的質(zhì)粒用于基因定點(diǎn)突變,否則Dpn I 不能把沒有酶切的質(zhì)粒DNA 切除,產(chǎn)生大量的假陽性。常用的大部分大腸桿菌都是dam+的,包括DH5α、JM109等。不能使用JM110和SCS110以及其它dcm-菌種。
2. 待突變質(zhì)粒和目的基因的GC含量應(yīng)該在40-55%,沒有任何GC含量超過70%、長(zhǎng)度在50bp以上的區(qū)域。如果質(zhì)粒GC含量過高,請(qǐng)先把目的基因克隆到其它合適的載體上,再進(jìn)行基因定點(diǎn)突變反應(yīng)。如果目的基因GC含量過高,而突變位點(diǎn)不在高GC含量區(qū)域,可以先把該基因的不含高GC含量的一個(gè)區(qū)域克隆出來,進(jìn)行定點(diǎn)突變,然后再把突變后的片斷克隆回原基因中。如果突變位點(diǎn)在高GC 區(qū),則可以使用高GC 專用PCR反應(yīng)試劑。
三、基因定點(diǎn)突變反應(yīng)
1.在一個(gè)塑料離心管中加入下列成分:
待突變模板質(zhì)粒
0.1-0.5μg
5×高保真酶Buffer
10μl
引物一(10-20 uM)
1μl
引物二(10-20 uM)
1μl
dNTP Mix(2.5mM each)
4μl
補(bǔ)水到
49μl
2. 加入1μl高保真DNA聚合酶,混勻,如果PCR儀沒有熱蓋則需要加少量石蠟油。放入PCR儀器中按下面參數(shù)進(jìn)行PCR:
步驟
溫度
時(shí)間
循環(huán)數(shù)
變性
95℃
1min
1次
PCR
95℃
40s
18次
60℃
1min
68℃
1min/Kb
延伸
72℃
10min
1次
保存
4℃
長(zhǎng)時(shí)間保持
四、Dpn I消化
PCR反應(yīng)后,直接在PCR反應(yīng)體系中加入1μL Dpn I內(nèi)切酶(該酶在甘油保存液中會(huì)下沉到管底,故用前需要充分混勻)。DpnI可以酶切雙鏈都被甲基化的模板質(zhì)粒,也能降解一條鏈被甲基化的雙鏈質(zhì)粒?;靹蚝?7℃孵育2小時(shí)后樣品可以直接用于轉(zhuǎn)化,或者-20℃保存?zhèn)溆谩?br />
五、轉(zhuǎn)化、挑克隆鑒定:
每100 微升感受態(tài)細(xì)菌(轉(zhuǎn)化效率必須在107/μg以上)中可以加入5-10微升經(jīng)過Dpn I 消化后的突變產(chǎn)物,按照所使用的感受態(tài)細(xì)菌的操作方法進(jìn)行操作。如果PCR 使用了石蠟油,在轉(zhuǎn)化時(shí)千萬別把它帶入轉(zhuǎn)化反應(yīng),否則會(huì)嚴(yán)重影響轉(zhuǎn)化效率。
在涂板前通過離心濃縮的辦法,把所有被轉(zhuǎn)化后的細(xì)菌全部涂布到含有適當(dāng)抗生素的平板上培養(yǎng)過夜。通常會(huì)得到50個(gè)以下的克隆,可按常規(guī)方法制備質(zhì)粒并測(cè)序。
六、常見問題:
1.轉(zhuǎn)化后沒有克隆或克隆數(shù)少:
(1)感受態(tài)細(xì)菌效率不夠高,請(qǐng)檢測(cè)一下感受態(tài)細(xì)胞的效率,確保轉(zhuǎn)化效率在107/μg。
(2)把Dpn I 消化后的產(chǎn)物用常規(guī)的乙醇沉淀濃縮,這樣就可以把所有的產(chǎn)物全部用于轉(zhuǎn)化。
(3)優(yōu)化基因定點(diǎn)突變中的PCR參數(shù)。可以把zuì初的95℃變性時(shí)間延長(zhǎng)為2分鐘,循環(huán)中95℃變性的時(shí)間延長(zhǎng)至1分鐘,把循環(huán)中的68℃的延伸時(shí)間改為1.5分鐘/kb 至2分鐘/kb,退火可以改為60-55℃或65-55℃等的touch down,退火時(shí)間也可以適當(dāng)延長(zhǎng)。
(4)引物設(shè)計(jì)有問題。通過突變反應(yīng)中的PCR 沒有很好地?cái)U(kuò)增出預(yù)期的突變質(zhì)粒。
2.有克隆,但沒有或很難檢測(cè)到預(yù)期的突變克?。?br />
使用的待突變的模板質(zhì)粒量過多,導(dǎo)致Dpn I 消化時(shí)不完全,可減少質(zhì)粒用量。
3. 有突變克隆,但突變位點(diǎn)不是預(yù)期的位點(diǎn):
(1)引物設(shè)計(jì)不佳,退火溫度過低,導(dǎo)致引物退火到錯(cuò)誤的地方。
(2)引物質(zhì)量較差,沒有經(jīng)過PAGE 純化。這樣引物中通常會(huì)含有比設(shè)計(jì)的引物要短的特異性較差的引物,容易導(dǎo)致非預(yù)期的突變。
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名稱:ACVR2A mRNA原位雜交試劑盒
貨號(hào):ZN0022
規(guī)格:100T
基本信息:
保存條件:4℃保存一年
工作量:100張切片。
有效期:一年。
適用種屬:human
標(biāo)記方式:3’—尾段標(biāo)記
試劑盒中內(nèi)容:
1.胃蛋白酶(×10; Pepsin)2ml;
2.預(yù)雜交液 2ml;
3.ACVR2A mRNA原位雜交試劑盒寡核苷酸探針雜交液 2ml;
4.封閉液 5ml;
5.生物素化鼠抗地高xīn 5ml;
6.SABC-POD 5ml;
7.生物素化過氧化物酶 5ml。
用戶自備試劑:
原位雜交專用蓋玻片;POLY-L-LYSINE;DEPC;20%甘油
緩沖液(3%檸檬酸,2×SSC,0.5×SSC,0.2×SSC,原位雜交用 PBS)
一.培養(yǎng)細(xì)胞和冰凍切片
準(zhǔn)備工作:
固定液:4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6);1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6)
3%檸檬酸——100ml蒸餾水中加檸檬酸(C6H8O7?H2O)3g,PH2.0左右。
2×SSC——1000ml蒸餾水中加氯化鈉17.6g,檸檬酸三鈉(C6H5O7Na3?2H2O,分子量294)8.8g。
0.5×SSC——300ml蒸餾水加100ml 2×SSC即可。
0.2×SSC——270ml蒸餾水加30ml 2×SSC即可。
20%甘油——20ml甘油加80ml蒸餾水即可。
原位雜交用PBS(1000ml蒸餾水加氯化鈉30g,Na2HPO4?12H2O 6g,NaH2PO4?2H2O 0.4g),PH7.2-7.6。
操作程序:
注意:zuì重要的是及時(shí)固定,并在固定液中加入0.1%的DEPC處理,以抑制RNA酶對(duì)mRNA的分解作用。此外,過度固定對(duì)原位雜交有明顯的不利影響。
1.玻片的處理:一般采用多聚賴氨酸或APES。切片厚度10-20μm。
2.細(xì)胞在多聚賴氨酸處理的蓋玻片上進(jìn)行培養(yǎng),條件為37℃和5%的CO2,所用培養(yǎng)基為Dulbecco基礎(chǔ)培養(yǎng)基。細(xì)胞長(zhǎng)好后0.1M PBS(PH7.4)洗2分鐘×3次。
3.培養(yǎng)細(xì)胞和冰凍切片均可用下述方法固定:固定液為4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室溫固定 20--30分鐘。蒸餾水充分洗滌,干燥后-20℃冰凍可保存2周以上。
4.30%H2O2 1份+純甲醇50份混合,室溫處理30分鐘。蒸餾水洗滌3次。
5.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%檸檬酸新鮮稀釋的胃蛋白酶(1ml 3% 檸檬酸加2滴濃縮型胃蛋白酶,混勻),37℃或室溫消化5—120秒鐘。有時(shí)也可以不消化。原位雜交用 PBS洗3次×5分鐘。蒸餾水洗1次。
6.后固定:胃蛋白酶消化后才需要。固定液為1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室溫固定 10分鐘。蒸餾水洗滌3次。
7.預(yù)雜交:濕盒的準(zhǔn)備——干的雜交盒底部加20%甘油20ml以保持濕度。按每張切片20μι加預(yù)雜交液。恒溫箱38-42℃2—4小時(shí)。吸取多余液體,不洗。
8.雜交——按每張切片20μι雜交液,加在切片上。將原位雜交專用蓋玻片的保護(hù)膜揭開后,蓋在切片上。恒溫箱38-42℃雜交過夜(根據(jù)雜交情況可以調(diào)節(jié))。
9.雜交后洗滌:揭掉蓋玻片,37℃左右水溫的2×SSC洗滌5分鐘×2次;37℃0.5×SSC洗滌15分鐘×1次; 37℃0.2×SSC洗滌15分鐘×1次(如果有非特異性染色,重復(fù)0.2×SSC洗滌15分鐘×1-2次)。
10.滴加封閉液:37℃30分鐘。甩去多余液體,不洗
11.滴加生物素化鼠抗地高xīn:37℃ 60分鐘或室溫120分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×4次。勿用其它緩沖液和蒸餾水洗滌。
12.滴加SABC:37℃20分鐘或室溫30分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×3次。勿用其它緩沖液和蒸餾水洗滌。
13.滴加生物素化過氧化物酶:37℃20分鐘或室溫30分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×4次。
14.DAB顯色:使用DAB顯色試劑盒—1ml蒸餾水加顯色劑A,B,C各一滴,混勻,加至標(biāo)本上。一般顯色20-30分鐘。若無背景出現(xiàn)則可繼續(xù)顯色。也可自配DAB顯色劑后顯色。充分水洗。
15.必要時(shí)蘇木素復(fù)染,充分水洗。
16.酒精脫水,二甲苯透明,封片。
二.石蠟切片
如果有條件的話,應(yīng)盡可能地采用新鮮標(biāo)本。標(biāo)本離體后,及時(shí)予以固定。固定液為4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.0-7.6),含有1/1000 DEPC。標(biāo)本較大時(shí)用刀片切成厚度不超過4mm的小塊,固定1小時(shí)即可,較大的標(biāo)本固定不要超過2小時(shí)。某些組織對(duì)過度固定尤其敏感,如動(dòng)物大腦,固定時(shí)間30-40分鐘,一般不要超過1小時(shí)。
1.常規(guī)脫水、浸蠟、包埋。切片厚度6-8μm。
2.玻片的處理:一般采用多聚賴氨酸或APES。
3.石蠟切片經(jīng)常規(guī)脫蠟至水。30%H2O2 1份+蒸餾水10份混合,室溫5-10分鐘以滅活內(nèi)源性酶。蒸餾水洗3次。
4.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%檸檬酸新鮮稀釋的胃蛋白酶(1ml 3% 檸檬酸加2滴濃縮型胃蛋白酶,混勻),37℃或室溫消化3--30分鐘(視標(biāo)本新舊、厚薄自行調(diào)整)。用戶可以比較不同的消化時(shí)間,例如5分鐘,10分鐘,20分鐘,30分鐘。以找到zuì佳的消化時(shí)間。原位雜交用PBS洗3次×5分鐘。蒸餾水洗1次。其余步驟和冰凍切片6-16步相同。
結(jié)果觀察:
ACVR2A的細(xì)胞胞漿著色呈棕黃色。
注意事項(xiàng):
由于特定的mRNA序列僅占總mRNA的少數(shù),加上基因僅由四個(gè)堿基排列組合而成,因此原位雜交容易出現(xiàn)非特異性染色。通過不加探針和用陰性標(biāo)本做對(duì)照,基本可以確定染色是否為特異性的。有明顯的非特異性染色現(xiàn)象時(shí),用預(yù)雜交液對(duì)含探針的雜交液進(jìn)行稀釋,一般稀釋2—10倍;并應(yīng)加強(qiáng)探針雜交后的洗滌。如果有少量的細(xì)胞核著色屬于正常情況;如果出現(xiàn)大量的細(xì)胞核著色,往往和標(biāo)本固定時(shí)間過長(zhǎng)有關(guān),應(yīng)重新處理標(biāo)本。
如果您覺得“BTN100212 一管式點(diǎn)突變?cè)噭┖小泵枋鲑Y料不夠齊全,請(qǐng)聯(lián)系我們獲取詳細(xì)資料。(聯(lián)系時(shí)請(qǐng)告訴我從給覽網(wǎng)看到的,我們將給您最大優(yōu)惠!)
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產(chǎn)品貨號(hào):BTN100212
產(chǎn)品規(guī)格:10次
基因的定點(diǎn)突變是重要的分子生物學(xué)技術(shù),廣泛用于載體構(gòu)建、基因改造、蛋白質(zhì)功能研究等領(lǐng)域。但傳統(tǒng)的方法需要使用單鏈DNA 模板,而得到單鏈DNA 模板又需要先將基因克隆到類似M13 這種載體中,操作過程冗長(zhǎng)。為了克服這些缺點(diǎn),本公司將突變位點(diǎn)設(shè)計(jì)到一對(duì)互補(bǔ)的引物中,用高保真擴(kuò)增質(zhì)粒模板,然后用Dpn I 去除原始的甲基化模板,新合成的DNA 通過互補(bǔ)形成帶切口的雙鏈質(zhì)粒,直接用于轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)菌。
產(chǎn)品特點(diǎn):
1. 直接使用質(zhì)粒DNA作為模板,免去了制備單鏈DNA的步驟。
2.基于高保真PCR,對(duì)模板DNA 序列沒特殊要求,可以用于突變?nèi)魏涡蛄?。同時(shí)對(duì)模板的需求量很少。
3.一管式,全部在一個(gè)優(yōu)化的緩沖體系中完成,非常簡(jiǎn)單。
4. 使用Dpn I 去除未突變模板,突變效率高達(dá)90%。
5.可用于制備點(diǎn)突變,缺失突變和插入突變。
6. 本產(chǎn)品A型適用于8 kb以下,B型適用于8-15 kb。
試劑盒組成:
成分 | 10T(A型) | 10T(B型) |
高保真酶A型 | 10μl | 無 |
高保真酶B型 | 無 | 10μl |
5×高保真酶Buffer A型 | 100μl | 無 |
5×高保真酶Buffer B型 | 無 | 100μl |
dNTP(2.5mM each) | 50μl | 50μl |
Dpn I酶 | 10μl | 10μl |
超純水 | 1ml | 1ml |
儲(chǔ)存條件:低溫運(yùn)輸、-20℃保存,有效期一年。
使用方法:
一、引物設(shè)計(jì)及注意事項(xiàng)
用于特定基因突變的引物必須用戶單獨(dú)設(shè)計(jì),請(qǐng)參考如下一些基本原則進(jìn)行設(shè)計(jì)。
1. 共需設(shè)計(jì)兩條完全互補(bǔ)的一對(duì)引物,它們覆蓋要擴(kuò)增的突變區(qū)位點(diǎn),突變位點(diǎn)zuì好放在引物的中心。可以先集中設(shè)計(jì)一條,然后就可得互補(bǔ)的另一條引物。
2.引物的長(zhǎng)度通常為25-45個(gè)堿基。引物中突變位點(diǎn)任何一側(cè)都必需滿足Tm大于45的條件,Tm 計(jì)算方式為Tm=4×(GC 堿基數(shù))+2×(AT 堿基數(shù))。例如引物agtcaggccaattcgAAGcagtcgaattgccaag 就達(dá)到此標(biāo)準(zhǔn),它的突變位點(diǎn)AAG 所放位置使左側(cè)Tm=46;右側(cè)Tm=48,均大于45。
3. 盡量把引物的GC含量控制在40%-60%,結(jié)尾的1-3個(gè)堿基zuì好是G或C。
4. 盡量使引物不要產(chǎn)生非常穩(wěn)定的二級(jí)結(jié)構(gòu)和引物二聚體。
5. zuì好使用經(jīng)過PAGE 純化的引物或更高純度的引物。
二、待突變模板質(zhì)粒的選擇
1. 必需使用從dam+的大腸桿菌(這類菌中質(zhì)粒可以被甲基化)中抽提得到的質(zhì)粒用于基因定點(diǎn)突變,否則Dpn I 不能把沒有酶切的質(zhì)粒DNA 切除,產(chǎn)生大量的假陽性。常用的大部分大腸桿菌都是dam+的,包括DH5α、JM109等。不能使用JM110和SCS110以及其它dcm-菌種。
2. 待突變質(zhì)粒和目的基因的GC含量應(yīng)該在40-55%,沒有任何GC含量超過70%、長(zhǎng)度在50bp以上的區(qū)域。如果質(zhì)粒GC含量過高,請(qǐng)先把目的基因克隆到其它合適的載體上,再進(jìn)行基因定點(diǎn)突變反應(yīng)。如果目的基因GC含量過高,而突變位點(diǎn)不在高GC含量區(qū)域,可以先把該基因的不含高GC含量的一個(gè)區(qū)域克隆出來,進(jìn)行定點(diǎn)突變,然后再把突變后的片斷克隆回原基因中。如果突變位點(diǎn)在高GC 區(qū),則可以使用高GC 專用PCR反應(yīng)試劑。
三、基因定點(diǎn)突變反應(yīng)
1.在一個(gè)塑料離心管中加入下列成分:
待突變模板質(zhì)粒 | 0.1-0.5μg |
5×高保真酶Buffer | 10μl |
引物一(10-20 uM) | 1μl |
引物二(10-20 uM) | 1μl |
dNTP Mix(2.5mM each) | 4μl |
補(bǔ)水到 | 49μl |
2. 加入1μl高保真DNA聚合酶,混勻,如果PCR儀沒有熱蓋則需要加少量石蠟油。放入PCR儀器中按下面參數(shù)進(jìn)行PCR:
步驟 | 溫度 | 時(shí)間 | 循環(huán)數(shù) |
變性 | 95℃ | 1min | 1次 |
PCR | 95℃ | 40s | 18次 |
60℃ | 1min | ||
68℃ | 1min/Kb | ||
延伸 | 72℃ | 10min | 1次 |
保存 | 4℃ | 長(zhǎng)時(shí)間保持 |
四、Dpn I消化
PCR反應(yīng)后,直接在PCR反應(yīng)體系中加入1μL Dpn I內(nèi)切酶(該酶在甘油保存液中會(huì)下沉到管底,故用前需要充分混勻)。DpnI可以酶切雙鏈都被甲基化的模板質(zhì)粒,也能降解一條鏈被甲基化的雙鏈質(zhì)粒?;靹蚝?7℃孵育2小時(shí)后樣品可以直接用于轉(zhuǎn)化,或者-20℃保存?zhèn)溆谩?br />
五、轉(zhuǎn)化、挑克隆鑒定:
每100 微升感受態(tài)細(xì)菌(轉(zhuǎn)化效率必須在107/μg以上)中可以加入5-10微升經(jīng)過Dpn I 消化后的突變產(chǎn)物,按照所使用的感受態(tài)細(xì)菌的操作方法進(jìn)行操作。如果PCR 使用了石蠟油,在轉(zhuǎn)化時(shí)千萬別把它帶入轉(zhuǎn)化反應(yīng),否則會(huì)嚴(yán)重影響轉(zhuǎn)化效率。
在涂板前通過離心濃縮的辦法,把所有被轉(zhuǎn)化后的細(xì)菌全部涂布到含有適當(dāng)抗生素的平板上培養(yǎng)過夜。通常會(huì)得到50個(gè)以下的克隆,可按常規(guī)方法制備質(zhì)粒并測(cè)序。
六、常見問題:
1.轉(zhuǎn)化后沒有克隆或克隆數(shù)少:
(1)感受態(tài)細(xì)菌效率不夠高,請(qǐng)檢測(cè)一下感受態(tài)細(xì)胞的效率,確保轉(zhuǎn)化效率在107/μg。
(2)把Dpn I 消化后的產(chǎn)物用常規(guī)的乙醇沉淀濃縮,這樣就可以把所有的產(chǎn)物全部用于轉(zhuǎn)化。
(3)優(yōu)化基因定點(diǎn)突變中的PCR參數(shù)。可以把zuì初的95℃變性時(shí)間延長(zhǎng)為2分鐘,循環(huán)中95℃變性的時(shí)間延長(zhǎng)至1分鐘,把循環(huán)中的68℃的延伸時(shí)間改為1.5分鐘/kb 至2分鐘/kb,退火可以改為60-55℃或65-55℃等的touch down,退火時(shí)間也可以適當(dāng)延長(zhǎng)。
(4)引物設(shè)計(jì)有問題。通過突變反應(yīng)中的PCR 沒有很好地?cái)U(kuò)增出預(yù)期的突變質(zhì)粒。
2.有克隆,但沒有或很難檢測(cè)到預(yù)期的突變克?。?br /> 使用的待突變的模板質(zhì)粒量過多,導(dǎo)致Dpn I 消化時(shí)不完全,可減少質(zhì)粒用量。
3. 有突變克隆,但突變位點(diǎn)不是預(yù)期的位點(diǎn):
(1)引物設(shè)計(jì)不佳,退火溫度過低,導(dǎo)致引物退火到錯(cuò)誤的地方。
(2)引物質(zhì)量較差,沒有經(jīng)過PAGE 純化。這樣引物中通常會(huì)含有比設(shè)計(jì)的引物要短的特異性較差的引物,容易導(dǎo)致非預(yù)期的突變。
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名稱:ACVR2A mRNA原位雜交試劑盒
貨號(hào):ZN0022
規(guī)格:100T
基本信息:
保存條件:4℃保存一年
工作量:100張切片。
有效期:一年。
適用種屬:human
標(biāo)記方式:3’—尾段標(biāo)記
試劑盒中內(nèi)容:
1.胃蛋白酶(×10; Pepsin)2ml;
2.預(yù)雜交液 2ml;
3.ACVR2A mRNA原位雜交試劑盒寡核苷酸探針雜交液 2ml;
4.封閉液 5ml;
5.生物素化鼠抗地高xīn 5ml;
6.SABC-POD 5ml;
7.生物素化過氧化物酶 5ml。
用戶自備試劑:
原位雜交專用蓋玻片;POLY-L-LYSINE;DEPC;20%甘油
緩沖液(3%檸檬酸,2×SSC,0.5×SSC,0.2×SSC,原位雜交用 PBS)
一.培養(yǎng)細(xì)胞和冰凍切片
準(zhǔn)備工作:
固定液:4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6);1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6)
3%檸檬酸——100ml蒸餾水中加檸檬酸(C6H8O7?H2O)3g,PH2.0左右。
2×SSC——1000ml蒸餾水中加氯化鈉17.6g,檸檬酸三鈉(C6H5O7Na3?2H2O,分子量294)8.8g。
0.5×SSC——300ml蒸餾水加100ml 2×SSC即可。
0.2×SSC——270ml蒸餾水加30ml 2×SSC即可。
20%甘油——20ml甘油加80ml蒸餾水即可。
原位雜交用PBS(1000ml蒸餾水加氯化鈉30g,Na2HPO4?12H2O 6g,NaH2PO4?2H2O 0.4g),PH7.2-7.6。
操作程序:
注意:zuì重要的是及時(shí)固定,并在固定液中加入0.1%的DEPC處理,以抑制RNA酶對(duì)mRNA的分解作用。此外,過度固定對(duì)原位雜交有明顯的不利影響。
1.玻片的處理:一般采用多聚賴氨酸或APES。切片厚度10-20μm。
2.細(xì)胞在多聚賴氨酸處理的蓋玻片上進(jìn)行培養(yǎng),條件為37℃和5%的CO2,所用培養(yǎng)基為Dulbecco基礎(chǔ)培養(yǎng)基。細(xì)胞長(zhǎng)好后0.1M PBS(PH7.4)洗2分鐘×3次。
3.培養(yǎng)細(xì)胞和冰凍切片均可用下述方法固定:固定液為4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室溫固定 20--30分鐘。蒸餾水充分洗滌,干燥后-20℃冰凍可保存2周以上。
4.30%H2O2 1份+純甲醇50份混合,室溫處理30分鐘。蒸餾水洗滌3次。
5.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%檸檬酸新鮮稀釋的胃蛋白酶(1ml 3% 檸檬酸加2滴濃縮型胃蛋白酶,混勻),37℃或室溫消化5—120秒鐘。有時(shí)也可以不消化。原位雜交用 PBS洗3次×5分鐘。蒸餾水洗1次。
6.后固定:胃蛋白酶消化后才需要。固定液為1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室溫固定 10分鐘。蒸餾水洗滌3次。
7.預(yù)雜交:濕盒的準(zhǔn)備——干的雜交盒底部加20%甘油20ml以保持濕度。按每張切片20μι加預(yù)雜交液。恒溫箱38-42℃2—4小時(shí)。吸取多余液體,不洗。
8.雜交——按每張切片20μι雜交液,加在切片上。將原位雜交專用蓋玻片的保護(hù)膜揭開后,蓋在切片上。恒溫箱38-42℃雜交過夜(根據(jù)雜交情況可以調(diào)節(jié))。
9.雜交后洗滌:揭掉蓋玻片,37℃左右水溫的2×SSC洗滌5分鐘×2次;37℃0.5×SSC洗滌15分鐘×1次; 37℃0.2×SSC洗滌15分鐘×1次(如果有非特異性染色,重復(fù)0.2×SSC洗滌15分鐘×1-2次)。
10.滴加封閉液:37℃30分鐘。甩去多余液體,不洗
11.滴加生物素化鼠抗地高xīn:37℃ 60分鐘或室溫120分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×4次。勿用其它緩沖液和蒸餾水洗滌。
12.滴加SABC:37℃20分鐘或室溫30分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×3次。勿用其它緩沖液和蒸餾水洗滌。
13.滴加生物素化過氧化物酶:37℃20分鐘或室溫30分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×4次。
14.DAB顯色:使用DAB顯色試劑盒—1ml蒸餾水加顯色劑A,B,C各一滴,混勻,加至標(biāo)本上。一般顯色20-30分鐘。若無背景出現(xiàn)則可繼續(xù)顯色。也可自配DAB顯色劑后顯色。充分水洗。
15.必要時(shí)蘇木素復(fù)染,充分水洗。
16.酒精脫水,二甲苯透明,封片。
二.石蠟切片
如果有條件的話,應(yīng)盡可能地采用新鮮標(biāo)本。標(biāo)本離體后,及時(shí)予以固定。固定液為4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.0-7.6),含有1/1000 DEPC。標(biāo)本較大時(shí)用刀片切成厚度不超過4mm的小塊,固定1小時(shí)即可,較大的標(biāo)本固定不要超過2小時(shí)。某些組織對(duì)過度固定尤其敏感,如動(dòng)物大腦,固定時(shí)間30-40分鐘,一般不要超過1小時(shí)。
1.常規(guī)脫水、浸蠟、包埋。切片厚度6-8μm。
2.玻片的處理:一般采用多聚賴氨酸或APES。
3.石蠟切片經(jīng)常規(guī)脫蠟至水。30%H2O2 1份+蒸餾水10份混合,室溫5-10分鐘以滅活內(nèi)源性酶。蒸餾水洗3次。
4.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%檸檬酸新鮮稀釋的胃蛋白酶(1ml 3% 檸檬酸加2滴濃縮型胃蛋白酶,混勻),37℃或室溫消化3--30分鐘(視標(biāo)本新舊、厚薄自行調(diào)整)。用戶可以比較不同的消化時(shí)間,例如5分鐘,10分鐘,20分鐘,30分鐘。以找到zuì佳的消化時(shí)間。原位雜交用PBS洗3次×5分鐘。蒸餾水洗1次。其余步驟和冰凍切片6-16步相同。
結(jié)果觀察:
ACVR2A的細(xì)胞胞漿著色呈棕黃色。
注意事項(xiàng):
由于特定的mRNA序列僅占總mRNA的少數(shù),加上基因僅由四個(gè)堿基排列組合而成,因此原位雜交容易出現(xiàn)非特異性染色。通過不加探針和用陰性標(biāo)本做對(duì)照,基本可以確定染色是否為特異性的。有明顯的非特異性染色現(xiàn)象時(shí),用預(yù)雜交液對(duì)含探針的雜交液進(jìn)行稀釋,一般稀釋2—10倍;并應(yīng)加強(qiáng)探針雜交后的洗滌。如果有少量的細(xì)胞核著色屬于正常情況;如果出現(xiàn)大量的細(xì)胞核著色,往往和標(biāo)本固定時(shí)間過長(zhǎng)有關(guān),應(yīng)重新處理標(biāo)本。

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