BTN111109 DOP-PCR試劑盒

北京百奧萊博供應(yīng)的DOP-PCR試劑盒用于生化實(shí)驗(yàn)研究等領(lǐng)域,本品質(zhì)量穩(wěn)定,價位合理,需要DOP-PCR試劑盒等基因結(jié)構(gòu)和功能產(chǎn)品的客戶,請到我公司官網(wǎng)聯(lián)系我們。...
特別提示:包括DOP-PCR試劑盒在內(nèi),本公司的所有產(chǎn)品僅可用于科研實(shí)驗(yàn),嚴(yán)禁用于臨床醫(yī)療及其他非科研用途!
產(chǎn)品名稱:DOP-PCR試劑盒
英文名稱:Degenerate Oligo
產(chǎn)品貨號:BTN111109
產(chǎn)品規(guī)格:50次
DOP-PCR即簡并寡聚核苷酸引物PCR,是擴(kuò)增全基因組的方法之一,它利用中間含有6個隨機(jī)堿基的22nt引物,通過兩輪PCR(輪低溫復(fù)性,第二輪高溫復(fù)性)而將模板DNA擴(kuò)增。DOP-PCR擴(kuò)完整基因組的效率不如利用phi 29 DNA聚合酶的MDA,但在擴(kuò)增高度降解的痕量DNA 方面具有巨大,在法醫(yī)鑒定領(lǐng)域具有重要應(yīng)用。本產(chǎn)品就是在DOP-PCR基礎(chǔ)上進(jìn)行優(yōu)化而開發(fā)。
產(chǎn)品特點(diǎn):
1. 專門用于高度降解的DNA,方便,含有除模板DNA和引物以外的所有成份,簡化了準(zhǔn)備工作。
2. 優(yōu)化的引物濃度,使自連序列和非模板相關(guān)序列的合成。
3. 使用高保真酶,降低突變率。
4. 長度在300-1700bp 之間,平均500bp左右。
5. 模板基因DNA 用量一般為10-100pg。
6. 所得PCR產(chǎn)物可用于STR 多重?cái)U(kuò)增、比較基因組雜交、單染色體文庫構(gòu)建、基因組圖譜研究等。
試劑盒組成:
成分 | 規(guī)格 |
DOP-PCR Magic Mix | 750μl |
DOP-PCR引物(20pmol/μL) | 250μL |
超純水 | 1ml |
說明書 | 1份 |
儲存條件:低溫運(yùn)輸、-20℃保存,保存期限為12個月。不要反復(fù)凍融。
使用方法:
1.在一干凈的PCR 管中,加入下列成分:
成分 | 陰性對照 | 樣品 |
DOP-PCR MagicMix | 25μL | 25μL |
基因組DNA模板(自備)或單個細(xì)胞 | 不加 | 10-100pg(或一個單個細(xì)胞) |
DOP-PCR引物(20 pmol/μL) | 5μl | 5μl |
補(bǔ)水到 | 50μl | 50μl |
2. 放入PCR儀中按下列參數(shù)進(jìn)行DOP-PCR。
預(yù)變性 | 95℃ | 5min |
輪PCR(12個循環(huán)) | 94℃ | 1min |
30℃ | 1.5min | |
72℃(30℃升到72℃的時間設(shè)定為3分鐘) | 3min | |
第二輪PCR(35個循環(huán)) | 94℃ | 1min |
62℃ | 1min | |
72℃(每次循環(huán)后此步的保溫時間延長14秒) | 2min | |
延伸 | 72℃ | 7min |
4℃ | Forever |
3.結(jié)束后取5-10μl直接上樣電泳(不需要額外再加DNA上樣液),紅色染料電泳速度相當(dāng)于50bp DNA片段。DOP-PCR產(chǎn)物的長度一般在300-1700bp之間。
4. 所得DOP-PCR產(chǎn)物可以用于后續(xù)PCR檢測或其他分析。
根據(jù)您的關(guān)注的DOP-PCR試劑盒,您可能還對以下產(chǎn)品有需求:
名稱:CXCR3 mRNA原位雜交試劑盒
貨號:ZN0349
規(guī)格:100T
基本信息:
保存條件:4℃保存一年
工作量:100張切片。
有效期:一年。
適用種屬:rat,mouse
標(biāo)記方式:3’—尾段標(biāo)記
試劑盒中內(nèi)容:
1.胃蛋白酶(×10; Pepsin)2ml;
2.預(yù)雜交液 2ml;
3.CXCR3 mRNA原位雜交試劑盒寡核苷酸探針雜交液 2ml;
4.封閉液 5ml;
5.生物素化鼠抗地gāo辛 5ml;
6.SABC-POD 5ml;
7.生物素化過氧化物酶 5ml。
用戶自備試劑:
原位雜交專用蓋玻片;POLY-L-LYSINE;DEPC;20%甘油
緩沖液(3%檸檬酸,2×SSC,0.5×SSC,0.2×SSC,原位雜交用 PBS)
一.培養(yǎng)細(xì)胞和冰凍切片
準(zhǔn)備工作:
固定液:4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6);1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6)
3%檸檬酸——100ml蒸餾水中加檸檬酸(C6H8O7?H2O)3g,PH2.0左右。
2×SSC——1000ml蒸餾水中加氯化鈉17.6g,檸檬酸三鈉(C6H5O7Na3?2H2O,分子量294)8.8g。
0.5×SSC——300ml蒸餾水加100ml 2×SSC即可。
0.2×SSC——270ml蒸餾水加30ml 2×SSC即可。
20%甘油——20ml甘油加80ml蒸餾水即可。
原位雜交用PBS(1000ml蒸餾水加氯化鈉30g,Na2HPO4?12H2O 6g,NaH2PO4?2H2O 0.4g),PH7.2-7.6。
操作程序:
注意:zuì重要的是及時固定,并在固定液中加入0.1%的DEPC處理,以抑制RNA酶對mRNA的分解作用。此外,過度固定對原位雜交有明顯的不利影響。
1.玻片的處理:一般采用多聚賴氨酸或APES。切片厚度10-20μm。
2.細(xì)胞在多聚賴氨酸處理的蓋玻片上進(jìn)行培養(yǎng),條件為37℃和5%的CO2,所用培養(yǎng)基為Dulbecco基礎(chǔ)培養(yǎng)基。細(xì)胞長好后0.1M PBS(PH7.4)洗2分鐘×3次。
3.培養(yǎng)細(xì)胞和冰凍切片均可用下述方法固定:固定液為4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室溫固定 20--30分鐘。蒸餾水充分洗滌,干燥后-20℃冰凍可保存2周以上。
4.30%H2O2 1份+純甲醇50份混合,室溫處理30分鐘。蒸餾水洗滌3次。
5.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%檸檬酸新鮮稀釋的胃蛋白酶(1ml 3% 檸檬酸加2滴濃縮型胃蛋白酶,混勻),37℃或室溫消化5—120秒鐘。有時也可以不消化。原位雜交用 PBS洗3次×5分鐘。蒸餾水洗1次。
6.后固定:胃蛋白酶消化后才需要。固定液為1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室溫固定 10分鐘。蒸餾水洗滌3次。
7.預(yù)雜交:濕盒的準(zhǔn)備——干的雜交盒底部加20%甘油20ml以保持濕度。按每張切片20μι加預(yù)雜交液。恒溫箱38-42℃2—4小時。吸取多余液體,不洗。
8.雜交——按每張切片20μι雜交液,加在切片上。將原位雜交專用蓋玻片的保護(hù)膜揭開后,蓋在切片上。恒溫箱38-42℃雜交過夜(根據(jù)雜交情況可以調(diào)節(jié))。
9.雜交后洗滌:揭掉蓋玻片,37℃左右水溫的2×SSC洗滌5分鐘×2次;37℃0.5×SSC洗滌15分鐘×1次; 37℃0.2×SSC洗滌15分鐘×1次(如果有非特異性染色,重復(fù)0.2×SSC洗滌15分鐘×1-2次)。
10.滴加封閉液:37℃30分鐘。甩去多余液體,不洗
11.滴加生物素化鼠抗地gāo辛:37℃ 60分鐘或室溫120分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×4次。勿用其它緩沖液和蒸餾水洗滌。
12.滴加SABC:37℃20分鐘或室溫30分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×3次。勿用其它緩沖液和蒸餾水洗滌。
13.滴加生物素化過氧化物酶:37℃20分鐘或室溫30分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×4次。
14.DAB顯色:使用DAB顯色試劑盒—1ml蒸餾水加顯色劑A,B,C各一滴,混勻,加至標(biāo)本上。一般顯色20-30分鐘。若無背景出現(xiàn)則可繼續(xù)顯色。也可自配DAB顯色劑后顯色。充分水洗。
15.必要時蘇木素復(fù)染,充分水洗。
16.酒精脫水,二甲苯透明,封片。
二.石蠟切片
如果有條件的話,應(yīng)盡可能地采用新鮮標(biāo)本。標(biāo)本離體后,及時予以固定。固定液為4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.0-7.6),含有1/1000 DEPC。標(biāo)本較大時用刀片切成厚度不超過4mm的小塊,固定1小時即可,較大的標(biāo)本固定不要超過2小時。某些組織對過度固定尤其敏感,如動物大腦,固定時間30-40分鐘,一般不要超過1小時。
1.常規(guī)脫水、浸蠟、包埋。切片厚度6-8μm。
2.玻片的處理:一般采用多聚賴氨酸或APES。
3.石蠟切片經(jīng)常規(guī)脫蠟至水。30%H2O2 1份+蒸餾水10份混合,室溫5-10分鐘以滅活內(nèi)源性酶。蒸餾水洗3次。
4.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%檸檬酸新鮮稀釋的胃蛋白酶(1ml 3% 檸檬酸加2滴濃縮型胃蛋白酶,混勻),37℃或室溫消化3--30分鐘(視標(biāo)本新舊、厚薄自行調(diào)整)。用戶可以比較不同的消化時間,例如5分鐘,10分鐘,20分鐘,30分鐘。以找到zuì佳的消化時間。原位雜交用PBS洗3次×5分鐘。蒸餾水洗1次。其余步驟和冰凍切片6-16步相同。
結(jié)果觀察:
CXCR3的細(xì)胞胞漿著色呈棕黃色。
注意事項(xiàng):
由于特定的mRNA序列僅占總mRNA的少數(shù),加上基因僅由四個堿基排列組合而成,因此原位雜交容易出現(xiàn)非特異性染色。通過不加探針和用陰性標(biāo)本做對照,基本可以確定染色是否為特異性的。有明顯的非特異性染色現(xiàn)象時,用預(yù)雜交液對含探針的雜交液進(jìn)行稀釋,一般稀釋2—10倍;并應(yīng)加強(qiáng)探針雜交后的洗滌。如果有少量的細(xì)胞核著色屬于正常情況;如果出現(xiàn)大量的細(xì)胞核著色,往往和標(biāo)本固定時間過長有關(guān),應(yīng)重新處理標(biāo)本。

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