BTN81102 石蠟包埋組織RNA提取試劑盒

產(chǎn)品簡介
石蠟包埋組織RNA提取試劑盒的品牌是百奧萊博,是優(yōu)質(zhì)的RNA提取純化產(chǎn)品,本制品用于科研目的,我公司的石蠟包埋組織RNA提取試劑盒品質(zhì)上佳,經(jīng)過多年的開發(fā)生產(chǎn),已然非常成熟,歡迎廣大新老客戶訂購。...
產(chǎn)品詳細介紹
特別提示:包括石蠟包埋組織RNA提取試劑盒在內(nèi),本公司的所有產(chǎn)品僅可用于科研實驗,嚴禁用于臨床醫(yī)療及其他非科研用途!
產(chǎn)品名稱:石蠟包埋組織RNA提取試劑盒
英文名稱:FFPE RNA Extraction Kit
產(chǎn)品貨號:BTN81102
產(chǎn)品規(guī)格:30次
石蠟包埋組織本是珍貴的分子生物學(xué)研究材料,但是由于它們的保存時間一般都比較長,很不容易從中提取到可以進行PCR的RNA,存在的主要問題是RNA的降解和脫蠟過程中樣品的丟失。本產(chǎn)品是專門用于從甲醛和非甲醛固定的石蠟包埋組織中快提RNA的試劑
試劑盒特點:
1.一管式操作,避免了可能的交叉污染和樣品RNA的丟失。
2.含一步離心式脫蠟試劑,不需要使用有毒的二甲苯,健康環(huán)保。
3. 能有效去除基因組DNA的污染,得到的RNA可直接用于RT-PCR反應(yīng)。
4. 即開即用,客戶自己不需要準備額外的試劑。
試劑盒組成:
成分 | 規(guī)格 |
溶液A | 30mL |
溶液B | 3mL |
溶液C | 5mL |
溶液D | 15mL |
微量核酸沉淀劑 | 30mL |
RNase-free水 | 10mL |
說明書 | 1份 |
儲存條件:低溫運輸,4℃保存(溶液C需要-20℃放置),有效期一年。
使用方法:
1. 將5片厚度為6-8μM的石蠟包埋組織切片轉(zhuǎn)移到1.5mL塑料離心管(zuì好使用螺旋蓋離心管)中并加入1mL溶液A,在振蕩器上以zuì大速度振蕩10秒。
2. 加入75μL溶液B,在振蕩器上以zuì大速度振蕩10秒。
3. 7000×g室溫離心2分鐘,溶液將形成兩個相,其中組織切片位于下相。
4.小心吸棄上層液體。
5. 將離心管放入真空離心機中抽干下層的液體,一般需要一小時。
6. 加入150μL溶液C,55℃保溫過夜。
7. 短暫離心,95℃保溫10分鐘。
8. 加入0.5mL溶液D,充分震蕩半分鐘。
9. 加入0.1mL自備lǜ仿,振蕩器上充分振蕩混均30秒。
10. 13000-5000×g室溫離心3~5分鐘。
11. 將上清液(約0.6mL)轉(zhuǎn)移到另一干凈的1.5mL塑料離心管中。下層有機相(藍色)和中間層含有DNA和蛋白質(zhì),避免觸及,否則將產(chǎn)生蛋白質(zhì)和DNA污染。為保險起見,可以留下100μL上清液不取。同時吸取上清時zuì好緩慢進行,否則容易吸出交界面的不可見的DNA。
12.在上清液中加入兩倍體積的微量核酸沉淀劑,振蕩器上振蕩30秒混勻。
13. 13000-15000g室溫離心5分鐘,離心底的側(cè)面將形成RNA沉淀。如果需要提高RNA回收率,可以將離心時間延長到20或30分鐘。
14.小心吸棄上清液,注意不要吸棄RNA沉淀。
15.在含RNA沉淀的離心管中加入1mL自備的75%乙醇,振蕩混勻30秒。
16. 13000-15000g室溫離心1分鐘。
17.小心吸棄上清液,注意不要吸棄RNA沉淀。
18. 短暫快速離心,用移液槍小心吸棄殘留乙醇(約50μL)。注意不要吸棄沉淀。此步十分重要,否則殘留的乙醇會影響RNA的使用。
19.室溫放1-2分鐘后立即加入50-100μL RNA溶解液使RNA沉淀溶解。千萬不要用真空離心法使RNA沉淀過于干燥,否則RNA將變得十分難溶。樣品立即使用或存放于-80℃待用。
20. RNA完整性的電泳檢測:
21. RNA產(chǎn)量產(chǎn)率測定:將5-10μL RNA溶于TE緩沖液中(pH7.5-8.2之間)檢測其在OD260的光吸收。通過光吸收可以得出RNA濃度(1 OD260的RNA=40μg/mL),進而計算出RNA的產(chǎn)量(濃度×體積)和產(chǎn)率(RNA產(chǎn)量/組織用量)。
22. RNA純度測定:無污染的總RNA的OD260/OD280一般在1.8-2.1之間(具體數(shù)值與其堿基組成和溶液成分等多種因素有關(guān)),高于此范圍則分別表示樣品可能有蛋白質(zhì)污染,但一般不影響RT-PCR等反應(yīng)。
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貨號 | 名稱 | 規(guī)格 |
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試劑盒特點:
1. 操作簡單快速,只要十分鐘左右,可以全在室溫下進行。
2. 所得 RNA 質(zhì)量高,OD260/OD280一般在 1.9,不含基因 DNA污染。
3. 靈敏度高,可以從一個菌落中提取到普通電泳能夠檢測到的總 RNA。
4. 高于進口同類產(chǎn)品。
試劑盒組成:
成分 | 規(guī)格 |
細菌RNA提取試劑 | 100ml |
說明書 | 1份 |
儲存條件:常溫運輸,4℃保存,有效期一年。
使用方法:
1.在 1.5mL塑料離心管中離心收集0.2-1.5mL 新鮮細菌(注意:由于細菌RNA 半衰期十分短,所以,必須使用zuì新鮮細菌),吸盡液體培養(yǎng)基,加入1mL細菌RNA提取試劑盒并用槍充分吹打,確保細菌全部裂解,沒有塊狀物。
如果使用菌落,則用接種環(huán)小心將其轉(zhuǎn)移到裝有1mL細菌RNA提取試劑盒的1.5 m塑料離心管中,用移液槍吹打均勻。在細菌數(shù)較少時,建議使 用助沉劑 RNApp以提高 RNA 回收率。
2. 加入0.2mL lǜ仿,在振蕩器上充分振蕩混均 30秒(必須將管底的液體振蕩起來,否則不能有效將DNA 打斷和去除蛋白質(zhì))。
3. 12000~15000g室溫離心3分鐘。上清液無色,下層液呈籃色,中間為蛋白質(zhì)。小心將上清液轉(zhuǎn)移到另一干凈 1.5ml塑料離心管中,上清液體積約為0.6mL。為避免觸及中間層的DNA和蛋白質(zhì),建議分小量多次 吸取,并且只取 0.5mL,留 0.1mL左右。當細菌數(shù)量較少時,中間層十分松散,上清時很容易吸到下層有機相,需要更加小心。
4.在上清液中加入等體積的異丙醇,振蕩器上振蕩混均 30秒。
5. 12000~15000室溫離心 3-10分鐘,RNA 將在管底側(cè)面形成沉淀。
6.小心吸棄上清液,注意不要吸棄 RNA沉淀。
7.在離心管中加入1mL 75%乙醇,振蕩器上振蕩混均 30秒。
8. 12000~15000g室溫離心 1分鐘。
9.小心吸棄上清液,注意不要吸棄 RNA沉淀。
10. 重復(fù)第 8 到第 10 步一次。
11. 短暫快速離心,用移液槍小心吸棄殘留液(約50μl)。
12. 短暫放 1-2分鐘后加入適量 RNA 溶解液使 RNA沉淀溶解,可以立即使用或存放于-80℃長期保存。
13. RNA 完整性的電泳檢測:
如果需要做 Northern雜交,強烈建議用戶使用甲醛變性膠進行RNA電泳,因為非變性膠不能分離所有的RNA分子(BioTechniques,28:414,2000)。如果是簡單檢測,可以使用TAE或百奧萊博的SuperBuffer-2 DNA/RNA 兩用快速電泳液,但文獻報道必須使用變性上樣液(BioTechniques,9:558,1990)。普通 DNA上樣液不含變性劑,也沒經(jīng)過去 RNase處理,所以zuì好不要使用。 尤其需要注意的是不要使用TBE進行RNA電泳,因為TBE 所含硼酸是研究多糖的經(jīng)典方法----硼酸絡(luò)合法中的關(guān)鍵成分,硼酸通過與RNA 核糖中的羥基發(fā)生絡(luò)合反應(yīng),形成RNA分子內(nèi)或RNA分子間的絡(luò)合復(fù)合物,使同樣長度的RNA 具有不同的泳動速度,電泳條帶彌散,同時有大的RNA 絡(luò)合復(fù)合物遲留在加樣孔中(一般會誤以為是基因組DNA污染)。RNA分子內(nèi)或RNA分子間的絡(luò)合物的形成的多少和比例又與硼酸與RNA的數(shù)量比例有關(guān),而RNA樣品中污染的其他多糖(如植物中提取的RNA)也會參與此反應(yīng),使硼酸對RNA電泳的影響更復(fù)雜,所以TBE 對RNA電泳的影響沒有規(guī)律性和重復(fù)性。有的樣品可以使用有的又不行,zuì好是避免使用。
由于細菌細胞中70-80%的RNA為rRNA,后者又由23S(約3700nt),16S(約1700nt)和5S(約100nt)三種組成,所以變性膠電泳后應(yīng)該在UV下看見三條清晰的rRNA帶。由于核酸長度與結(jié)合 EB的數(shù)量成正比(當然還與RNA的二級結(jié)構(gòu)有關(guān),雙鏈部分結(jié)合能力比單鏈部分強),所以23S rRNA條帶的熒光強度一般比16S rRNA條帶的熒光強度強2倍。如果這兩條rRNA 帶不清晰或比例小于此范圍則表示 RNA 有降解(因為大的RNA 被酶降解的可能更大)。
14. RNA產(chǎn)量產(chǎn)率測定:
將5-10μl RNA 溶于TE緩沖液中(pH7.5-8.2 之間)檢測其在OD260的光吸收。通過光吸收可以得出 RNA濃度(1 OD260的RNA=40μg/mL),進而計算出 RNA的產(chǎn)量和產(chǎn)率。注意不要將RNA 稀釋在 DEPC 水中檢測 OD260和OD280,否則光吸收比在 TE中測得的低 10%-15%,因為核酸光吸收跟溶液 pH相關(guān),而 DEPC 水中的DEPC高壓分解后產(chǎn)生的CO2與水反應(yīng)生成碳酸,使溶液 pH降低進而降低 RNA的光吸收。
15. RNA 純度測定:
無污染的總 RNA的OD260/OD280一般在 1.8-2.1 之間(具體數(shù)值與其堿基組成和溶液成分等多種因素有關(guān)),OD260/OD230一般在2.0-2.3 之間,如果低于或高于此范圍則分別表示樣品可能有蛋白質(zhì)或多糖的污染,但一般不影響 RT-PCR等反應(yīng)。蛋白質(zhì)污染可以通過酚/lǜ仿抽提一次然后酒精沉淀去除,DNA和多糖污染可以分別用百奧萊博的DNAScavenger和PS Scavenger去除。
疑難解答:
Q:上樣孔里的紅色熒光物一定是污染的基因組DNA嗎?
A:不是。用 TAE或TBE電泳液和非變性膠電泳 RNA時容易產(chǎn)生此現(xiàn)象,百奧萊博初步研究發(fā)現(xiàn)大部分紅色熒光物是變性不充分的單鏈RNA 通過堿基互補或通過硼酸絡(luò)合(如果使用TBE作電泳液的話)形成的復(fù)合物,加 RNase處理后,這些紅色熒光物一般會消失。為避免此現(xiàn)象,建議zuì好使用甲醛變性膠電泳。如果需要使用非變性膠,也必須在上樣前使RNA變性。使用百奧萊博優(yōu)化的上樣/變性/染色三用溶液 RNAload可以使 RNA在非變性膠上電泳時也有較好分辨率。使用非變性膠時,可以使用TAE或超快電泳液SuperBuffer-2,zuì好不要使用TBE緩沖液,因為TBE中的硼酸能與RNA的多羥基形成復(fù)合物,RNA 很難形成銳利的條帶。
Q:如何確認和去處除污染的基因組 DNA?
A:如果懷疑有 DNA污染,可以用 RNase處理 RNA樣品,然后再電泳。如果上樣孔里的紅色熒光物不消失,則表示是基因組 DNA污染。進一步確認可以使用 PCR擴增法。去除污染的DNA可以使用非酶的DNA 去除劑DNA Scavenger或RNase-free DNase,由于RNase-free DNase一般都有殘留的RNase污染,所以必須嚴格按照廠家提供的使用說明書進行操作。

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